La linea evolutiva de este mamífero es la que se encuentra más alejada de la especie humana. (Este animal se diferenció hace unos 166 millones de años de su predecesor primitivo y es por tanto el mamífero más lejano de los seres humanos)
Su acercamiento a las aves y los reptiles, más que a los mamíferos se debe a que posee 5 pares de cromosomas dedicados a la determinación sexual.
El Ornitorrinco posee un olfato distinto al de las aves y los reptiles, además pueden olfatear debajo del agua. Sus crias sobreviven gracias a la eficacia antimicrobiana que poseen. La secuencia del genoma son unas series de características de mamífero mezcladas con amalga de ancestros reptilianos. Otro aspecto del genoma es, que los ornitorrincos poseen glándulas mamarias, producen leche pero no tienen pezones y sus crias chupan leche de los pelos de la madre.
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